Axes de recherches

Un triple axe de recherche
autour de la modélisation par intelligence artificielle

– Explorer les mécanismes immunologiques (communs ou opposés) mis en jeu dans la cancérogenèse et les réponses aux immunothérapie anticancéreuses, ainsi que dans la maladie auto-immune inflammatoire à risque accru de cancer. L’un des objectifs attendus est l’identification de signatures immunologiques des tissus cancéreux, inflammatoires et sains.

– Innovations diagnostiques et thérapeutiques fondées sur l’utilisation de nouveaux outils de modélisation du cancer comme les organoïdes ou les sphéroïdes de tumeurs ou d’organes cibles de maladies auto-immunes. Des techniques innovantes de culture cellulaire seront utilisées pour concevoir et tester à large échelle de nouvelles immunothérapies anticancéreuses ou anti-inflammatoires.

– Essais cliniques et nouvelles prises en charge patients : La mise en place d’essais thérapeutiques évaluant de nouvelles immunothérapies ou de nouvelles associations avec, par exemple, des anti-cytokines inflammatoires (TNF, IL-6, IL-13), permettra le développement de traitements anticancéreux ou à visée immunologique.

– La modélisation par intelligence artificielle intègrera l’ensemble des paramètres cliniques, biologiques et environnementaux grâce à l’implication de mathématiciens, data scientists, et épidémiologistes utilisant des méthodes d’apprentissage automatique par deep learning appliquées aux données partagées et collectées dans le cadre du DIM. L’objectif sera de développer des modèles capables de prédire les réponses aux traitements et leurs effets secondaires.

Création d’une banque de données clinico-biologiques
et de deux plateformes expérimentales

Pour créer cet écosystème d’experts pluridisciplinaires, les premiers projets visent à créer deux plateformes expérimentales ouvertes aux équipes de recherche partenaires du réseau et une banque de données :

– Une infrastructure digitale de recherche en Immuno-Onco-Auto-Immunité couplée à une collection biologique hautement caractérisée.

– Une plateforme d’analyses immunologiques de pointe se focalisant sur l’analyse au niveau transcriptomique, épitranscriptomique, métabolomique et protéomique de tissus issus de patients atteints de cancers ou de maladies auto-immunes ayant développé des cancers.

 – La création d’une base de données interopérable ITAC (rétrospective et prospective). C’est l’un des projets structurants de ce programme. Elle permettra de promouvoir la recherche en immunothérapie et cross fertiliser les deux secteurs applicatifs que sont l’oncologie et les maladies auto-immunes en intégrant les bases de données existantes. Déployée dans les centres recruteurs, cette base de données évoluera de manière dynamique dans le temps en intégrant l’apprentissage de données épidémiologiques, environnementales et nutritionnelles. Elle a vocation à s’ouvrir à des initiatives nationales et européennes.

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